La gare de « Haeltert » fut inaugurée en même temps que la ligne 89, le 14 décembre 1868.  Après avoir été provisoire, la gare définitive fut probablement construite peu avant le tournant du siècle. Il s’agissait d’un bâtiment classique de l’État belge composé de trois parties: une partie centrale à étage et deux parties latérales symétriques sans étage. La bâtiment se distinguait toutefois par les arcs au-dessus des portes et des fenêtres et les ornements décoratifs supplémentaires sur les façades.

Le hangar aux marchandises était situé en face de la gare, avec une voie de garage située près du quai et deux voies de déchargement. Ce hangar a été agrandi vers 1900 et complété par un quai de chargement surélevé. Après plusieurs fermetures pendant la première guerre mondiale, la gare a rouvert en 1920. En 1938, l’orthographe actuelle « Haaltert » a été adoptée.

Le hangar à marchandises a été démoli avant 1975 et une partie du quai de déchargement a été transformée en parking pour la gare. Quelques années plus tard, en 1981, le reste de ce quai a été complètement fermé et également transformé en parking. À cette époque, les guichets ont également été fermés et la gare a ensuite été vendue. Aujourd’hui, l’ancien bâtiment principal est une habitation privée qui a gardé pratiquement son style d’origine. Les quais ont été surélevés et modernisés au début des années 2000.